Исходный сайт - наследие еще с 7 версии, часть модулей ставилась руками, часть через композер, при попытке вручную отключить/удалить модули начнаюьтся глюки, поэтому возможно придется пойти чуть обходным путем и сначала сделать копию текущего сайта, но с пакетом модулей собранных правильно.

1) сделать чистую установку D9.4, собрать вручную все нужные модули через композер, импортировать в него контент из старого сайта

2) обновить до D11, вернуть обновленное на Prod

Ну вот вроде и все, что требуется :) 

Тому кто при этом еще и удобно dev-prod настроит, дополнительная благодарность и премия и все такое.